BioMedR

v1.0.0 AGPL-3.0

BioMedR 软件包提供了一个 R 软件包，用于生成化学物质、蛋白质、DNA/RNA 及其相互作用的各种分子描述符。此外，该软件包还实现了一些相似性搜索方法和强大的聚类方法以及一些有用的辅助工具，旨在构建从数据采集、数据检查和描述符计算到建模的集成分析管道。

技术栈
Python 2.7 PyTorch Django 1.5
GitHub
核心功能
  • • 生成化学物质、蛋白质、DNA/RNA 及其相互作用的各种分子描述符
  • • 数据采集、数据检查
论文引用
  • IF 6.8
    BioMedR: an R/CRAN package for integrated data analysis pipeline in biomedical study
    Jie Dong, Min-Feng Zhu, Yong-Huan Yun, Ai-Ping Lu, Ting-Jun Hou, Dong-Sheng Cao | Briefings in Bioinformatics, 2021
    doi.org/10.1093/bib/bbz150